富。其次是低山次生灌丛，然后依次是针阔混交林、针叶林、高山灌丛草甸。在裸、房屋和溪流生境中种类最少。
景区里珍惜动物也很丰富，国家保护动物一级有大熊猫、川金丝猴、扭角羚、云豹、豹、绿尾虹雉、玉带海雕；二级有小熊猫、金猫、兔狲、猞猁、水鹿、马鹿、林麝、斑羚、羊、红腹角雉、藏马鸡、藏雪鸡、血雉、蓝马鸡等。
植物的话，就更多了，据不完全统计，区内有国家保护植物连香树、水青树、四川红杉、铁杉、红豆杉，还有中国特有或区内特有的植物如：雪莲花，麦吊云杉、厚朴、密枝圆柏、松潘杈子柏。保护区内云杉、冷杉属植物种类多，箭竹分布广泛，为大熊猫栖息的良好场所。
从黄龙沟底部到山顶依次出现亚热带常绿与落叶阔叶混交林、针叶阔叶混交林、亚高山针叶林、高山灌丛草甸等。